Genomy chromeridních řas

Michálek, Jan

dc.contributor.advisor	Oborník, Miroslav
dc.contributor.author	Michálek, Jan
dc.date.accessioned	2024-03-12T08:15:18Z
dc.date.available	2024-03-12T08:15:18Z
dc.date.issued	2020
dc.date.submitted	2020-09-24
dc.identifier.uri	https://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/42886
dc.description.abstract	Tato práce se zabývá anotací genomů významné skupiny alveolátních řas, které jsou nejbližšími příbuznými parazitů ze skupiny sporozoa (výtrusovci). Analýza, kombinující in-silico přístup s experimenty, je zaměřena na popis jejich mitochondriálních genomů a hledání biosyntetických drah, které jsou životně důležité pro sporozoa. Úvodní studie popisuje mitochondriální genomy řas Chromera velia a Vitrella brassicaformis a navrhuje model jejich neobvykle divergentních dýchacích řetězců. Následující studie shrnuje celkový popis jaderných genomů obou druhů chromerid s důrazem na vlastnosti sdílené s parazity z řad výtrusovců a jde po stopách evolučních proměny fototrofního předchůdce v dnešní obligátní parazity. Studie je zakončena zevrubnou biochemickou, genetickou a evoluční analýzou biosyntézy mastných kyselin v chromeridních řasách.	cze
dc.format	129
dc.format	129
dc.language.iso	eng
dc.publisher	Jihočeská univerzita	cze
dc.rights	Bez omezení
dc.subject	Chromeridní řasy	cze
dc.subject	Sporozoa	cze
dc.subject	genom	cze
dc.subject	evoluce	cze
dc.subject	Chromerid algae	eng
dc.subject	Sporozoa	eng
dc.subject	genome	eng
dc.subject	evolution	eng
dc.title	Genomy chromeridních řas	cze
dc.title.alternative	Genomes of Chromerid Algae	eng
dc.type	disertační práce	cze
dc.identifier.stag	30997
dc.description.abstract-translated	This work is mainly focused on the annotation of genomes of an important group of alveolate algae, which are the closest known phototrophic relatives of sporozoan parasites. The analysis is aimed to annotate their mitochondrial and nuclear genomes and search for biosynthetic pathways essential for sporozoans by combining the in-silico approach with supportive experiments. The initial study describes mitochondrial genomes of Chromera velia and Vitrella brassicaformis and models their unprecedently divergent respiratory chains. The following study summarizes the general characteristics of nuclear genomes of the two chromerids, highlights main genomic features shared with apicomplexan parasites, and traces the evolutionary transitions from the phototrophic ancestor to the obligate apicomplexan parasites. The study was completed by a comprehensive biochemical, genetic, and evolutionary analyses of fatty acid biosynthesis in chromerids.	eng
dc.date.accepted	2020-11-16
dc.description.department	Přírodovědecká fakulta	cze
dc.thesis.degree-discipline	Molekulární a buněčná biologie a genetika	cze
dc.thesis.degree-grantor	Jihočeská univerzita. Přírodovědecká fakulta	cze
dc.thesis.degree-name	Ph.D.
dc.thesis.degree-program	Molekulární a buněčná biologie	cze
dc.description.grade	Dokončená práce s úspěšnou obhajobou	cze
dc.contributor.referee	Petersen, Jörn
dc.contributor.referee	Prášil, Ondřej