| dc.contributor.author | Stehlíková, Dagmar | cze |
| dc.contributor.author | Tonka, Tomáš | cze |
| dc.contributor.author | Křížová, Lucie | cze |
| dc.contributor.author | Čurn, Vladislav | cze |
| dc.date.accessioned | 2021-03-04T17:42:46Z | |
| dc.date.available | 2021-03-04T17:42:46Z | |
| dc.date.issued | 2019 | cze |
| dc.identifier.issn | 0139-6013 | cze |
| dc.identifier.uri | https://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/626 | |
| dc.description.abstract | Předmětem této práce je optimalizace metody loop-mediated isothermal amplification (LAMP) pro specifickou detekci václavky Armillaria cepistipes, kterou by bylo možné použít při terénních determinacích tohoto druhu. Tato houba je jedním ze sedmi druhů parazitických václavek, vyskytujících se zejména na jehličnatých stromech na celém území Evropy. Pro rozlišení jednotlivých druhů václavek na molekulární úrovni byly navrženy primery a asimilační sondy pro gen kódující translační elongační faktor 1-alfa (tefa). LAMP metoda byla optimalizována na přenosnou platformu Smart-DART (Diagenetix, USA), kterou lze využít k přímé a rychlé, druhově specifické detekci A. cepistipes ještě před objevením příznaků infekce napadených stromů václavkou díky vysoké citlivosti metody, detekující i nízké koncentrace (0,4 ng/µl) DNA izolované z rhizomorf. | cze |
| dc.format | p. 231-234 | cze |
| dc.language.iso | cze | cze |
| dc.publisher | Profi Press s.r.o. | cze |
| dc.relation.ispartof | Úroda, volume 12, issue: LXVII | cze |
| dc.subject | Primery | cze |
| dc.subject | asimilační sonda | cze |
| dc.subject | václavky | cze |
| dc.subject | přenosná platforma | cze |
| dc.subject | tef1 | cze |
| dc.subject | Primers | eng |
| dc.subject | assimilating probe | eng |
| dc.subject | Armillaria spp. | eng |
| dc.subject | portable platform | eng |
| dc.subject | tefa | eng |
| dc.title | Detekce Armillaria cepistipes metodou loop-mediated isothermal amplification | cze |
| dc.title.alternative | Detection Armillaria cepistipes using loop-mediated isothermal method | eng |
| dc.type | article | cze |
| dc.identifier.obd | 43885056 | cze |
| dc.description.abstract-translated | The subject of study is optimization loop-mediated isothermal amplification method (LAMP) for field detection of the Armillaria cepistipes. This fungus is one of the Armillaria spp. parasitized coniferous stands in Europe. For complex differentiation of these species the translational elongation factor 1-alpha (tefa) gene was selected for the design of primers and assimilation probe. This method was optimized to the Smart-DART portable platform (Diagenetix, USA), which can be used in the field for rapid and specific detection of A. cepistipes. This method is highly sensitive with a detection limit of 0.4 ng /µl of DNA isolated from rhizomorph. | eng |
| dc.peerreviewed | yes | cze |
| dc.publicationstatus | postprint | cze |
| dc.relation.publisherversion | https://digi.profipress.cz/katalog/detail/uroda | cze |
