Ověření souvislosti genů enol-1 a astacinu s evoluční adaptací na parazitismus u druhu Heterorhabditis bacteriophora

Hartmann, Jan

dc.contributor.advisor	Žurovcová, Martina
dc.contributor.author	Hartmann, Jan
dc.date.accessioned	2024-03-12T08:14:29Z
dc.date.available	2024-03-12T08:14:29Z
dc.date.issued	2020
dc.date.submitted	2020-02-22
dc.identifier.uri	https://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/42849
dc.description.abstract	Zaměřením této práce byla možná spojitost dvou kandidátních genů, enol-1 a astacinové metalopeptidázy, s adaptacemi na parazitický způsob života u hlístice Heterorhabditis bacteriophora.Ačkoliv experimentální umlčování genů nepodporuje spojitost (zejména kvůli neuspěšné provedené metodě "soaking")biostatistická analýza ortologů z 25 druhů vybraných napříč klady III, IV a V nalezla známky episodické selekce. Bohužel nebyla zjištěna vazba na parazitické druhy, jelikož převažujícím typem selekce byla selekce purifikační. S větší pravděpodobností jsou kandidátní geny konzervované, než spojeny s adaptačním tlakem spojeným s parazitismem.	cze
dc.format	73
dc.format	73
dc.language.iso	cze
dc.publisher	Jihočeská univerzita	cze
dc.rights	Bez omezení
dc.subject	Evoluce parazitismu	cze
dc.subject	vliv selekce	cze
dc.subject	Entomopatogenní hlístovka	cze
dc.subject	Evolution of parasitism	eng
dc.subject	Selective pressure	eng
dc.subject	Entomopathogenic nematode	eng
dc.title	Ověření souvislosti genů <i>enol-1</i> a <i>astacinu</i> s evoluční adaptací na parazitismus u druhu <i>Heterorhabditis bacteriophora</i>	cze
dc.title.alternative	Verification of connection of the <i>enol-1</i> and <i>astacin metalloprotease</i> genes with evolutionary adaptation to parasitism of <i>Heterorhabditis bacteriophora</i>	eng
dc.type	diplomová práce	cze
dc.identifier.stag	55623
dc.description.abstract-translated	This thesis was focused on the verification wheter the two candidate genes, enol-1 and astacin metalloprotease, are linked to the parasitic adaptation of Heterorhabditis bacteriophora. While the expression analysis and knock-down of those genes by RNAi did not corroborate thwe hypothesis, biostatistical evolutionary analysis of orthologs from 25 nematode species across clades III, IV and V found several footprints of episodic diversifying selection. However, none of this was strictly linked to the parasitic species. Since the prevailing detected selection was purifying, both candidate genes are more likely conserved and not directly shaped by adaptation to parasitism.	eng
dc.date.accepted	2020-07-17
dc.description.department	Přírodovědecká fakulta	cze
dc.thesis.degree-discipline	Experimentální biologie - specializace Molekulární a buněčná biologie a genetika	cze
dc.thesis.degree-grantor	Jihočeská univerzita. Přírodovědecká fakulta	cze
dc.thesis.degree-name	Mgr.
dc.thesis.degree-program	Biologie	cze
dc.description.grade	Dokončená práce s úspěšnou obhajobou	cze
dc.contributor.referee	Hyršl, Pavel
dc.contributor.referee	Nguyen, Petr