Instalace a úprava bioinformatického serveru Galaxy
Loading...
Date
Authors
Steinhaisl, Jaroslav
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Jihočeská univerzita
Abstract
Práce se zabývá instalací a administrací Galaxy serveru s následnou konfigurací
a implementací programů vyvinutých na Ústavu molekulární biologie rostlin
Biologického centra Akademie věd České republiky, v. v. i. . Konfigurace obsahuje upravení výchozího nastavení serveru pro správnou spolupráci Galaxy
serveru s ProFTPD serverem, PostgreSQL databázového serveru a Portable
Batch System. Každý bioinformatický program byl zaveden pomocí konfigurace XML souboru, který je použit pro definování vstupů a výstupů programu.
Kombinace XML souboru s bioinformatickým programem byla následně testována na datech poskytnutých Laboratoří Molekulární Cytogenetiky.