Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21
Načítá se...
Datum
Autoři
Zimandl, Filip
Název časopisu
ISSN časopisu
Název svazku
Nakladatel
Jihočeská univerzita
Abstrakt
Tato bakalářská práce se týká teoretické studie flexibility fluorescenčního barviva QSY 21. Hlavním úkolem práce bylo najít energeticky nejstabilnější konformery ve vodném prostředí a poskytnout tak vhodnou startovní strukturu pro MD simulaci barviva navázaného na DNA. Dále byla spočtena bariéra rotace mezi centrálním xanthenovým kruhem a postranním aromatickým řetězcem. Výpočty prokázaly ve shodě se simulací molekulovou dynamikou, že se jedná o tzv. bráněnou rotaci.