| dc.contributor.advisor | Grubhoffer, Libor | |
| dc.contributor.author | Šimonová, Zuzana | |
| dc.date.accessioned | 2021-12-06T12:32:36Z | |
| dc.date.available | 2021-12-06T12:32:36Z | |
| dc.date.issued | 2008 | |
| dc.date.submitted | 2008-04-30 | |
| dc.identifier.uri | https://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/22981 | |
| dc.description.abstract | Srovnávala jsem genomové sekvence tří variant klíšťové encefalitidy, kmene Hypr. Konkrétně to byly: Hypr5 - pětkrát pasážovaný virus na mozcích sajících myšek, Hypr50/V - varianty vysocepasážovaná v laboratoři ve Vídni in vivo a Hypr50/CB - vysocepasážovaná varianta v laboratoři v Českých Budějovicích in vivo. Obě vysoce pasážované varianty byly také pasážované v mozcích myší.
Zaměřila jsem se na změny nukletidových sekvencí ve vysocepasážovaných variantách Hypr50/CB a Hypr50/V v porovnání s variantou Hypr5 a z nich vyplývající změny aminokyselinových sekvencí ve virových proteinech. Zaznamenala jsem několik změn identických pro obě vysocepasážované varianty a to v proteinech E, NS3 a NS5 a několik unikátních změn jen v jedné z variant v proteinech E, NS1, NS2A, NS2B a NS3. Nukleotidová substituce byla taktéž nalezena v 5'UTR oblasti virového genomu. | cze |
| dc.format | 53 s. | |
| dc.format | 53 s. | |
| dc.language.iso | cze | |
| dc.publisher | Jihočeská univerzita | cze |
| dc.rights | Bez omezení | |
| dc.subject | klíšťová encefalitida | cze |
| dc.subject | kmen Hypr | cze |
| dc.subject | vysocepasážované varianty | cze |
| dc.subject | pasážování | cze |
| dc.subject | změny v proteinech | cze |
| dc.subject | nukleotidová sekvence | cze |
| dc.subject | aminokyselinová sekvence | cze |
| dc.subject | tick-borne encephalitis virus | eng |
| dc.subject | strain Hypr | eng |
| dc.subject | highly passaged variant | eng |
| dc.subject | passage | eng |
| dc.subject | change in nucleotide sequence | eng |
| dc.subject | amino-acid sequence | eng |
| dc.title | Sekvenční analýza genomů viru KE, kmen Hypr, v různých pasážích v hostiteli <i>in vivo</i>. | cze |
| dc.title.alternative | Complete genome sequence analysis of TBE virus, strain Hypr, in different passages in host <i>in vivo</i>. | eng |
| dc.type | bakalářská práce | cze |
| dc.identifier.stag | 9745 | |
| dc.description.abstract-translated | I have compared genomic sequences of three variants of tick-borne encephalitis virus, strain Hypr. The variants used were Hypr5 - virus passaged five times in suckling mice brains, Hypr50/V - a variant highly passaged in vivo in Vienna, and Hypr50/CB - a variant highly passaged in vivo in České Budějovice. Both high-passage variants were passaged in suckling mouse brains as well.
I was interested in changes in nucleotide sequence of genomes of high-passage variants Hypr50/V and Hypr50/CB compared with Hypr5 and also consequential changes in amino-acid sequences of viral proteins. I have found several identical changes in amino-acid sequences of E protein, NS3 and NS5 proteins in both high-passage variants and also a number of substitutions unique to one of the variants in proteins E, NS1, NS2A, NS2B, and NS3. A nucleotide substitution was found also in 5’UTR of the viral genome. | eng |
| dc.date.accepted | 2008-06-02 | |
| dc.description.department | Přírodovědecká fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-discipline | Biomedicínská laboratorní technika | cze |
| dc.thesis.degree-grantor | Jihočeská univerzita. Přírodovědecká fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-name | Bc. | |
| dc.thesis.degree-program | Biologie | cze |
| dc.description.grade | Dokončená práce s úspěšnou obhajobou | cze |
| dc.contributor.referee | Kocáková, Paulina | |
