Zobrazit minimální záznam

Conformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21

dc.contributor.advisorKabeláč, Martin
dc.contributor.authorZimandl, Filip
dc.date.accessioned2021-12-06T13:08:00Z
dc.date.available2021-12-06T13:08:00Z
dc.date.issued2010
dc.date.submitted2010-05-24
dc.identifier.urihttps://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/23383
dc.description.abstractTato bakalářská práce se týká teoretické studie flexibility fluorescenčního barviva QSY 21. Hlavním úkolem práce bylo najít energeticky nejstabilnější konformery ve vodném prostředí a poskytnout tak vhodnou startovní strukturu pro MD simulaci barviva navázaného na DNA. Dále byla spočtena bariéra rotace mezi centrálním xanthenovým kruhem a postranním aromatickým řetězcem. Výpočty prokázaly ve shodě se simulací molekulovou dynamikou, že se jedná o tzv. bráněnou rotaci.cze
dc.format23 s., 8 s. příloh.
dc.format23 s., 8 s. příloh.
dc.language.isoeng
dc.publisherJihočeská univerzitacze
dc.rightsBez omezení
dc.subjectVýpočetní chemiecze
dc.subjectkvantová mechanikacze
dc.subjectflourescenční barvivocze
dc.subjectQSY 21cze
dc.subjectDNAcze
dc.subjectkonformacecze
dc.subjectstrukturacze
dc.subjectfluorescencecze
dc.subjectFRETcze
dc.subjectsimulacecze
dc.subjectComputational chemistryeng
dc.subjectquantum mechanicseng
dc.subjectfluorescence dyeeng
dc.subjectdark quenchereng
dc.subjectQSY 21eng
dc.subjectDNAeng
dc.subjectconformationeng
dc.subjectstructureeng
dc.subjectsimulationeng
dc.subjectfluorescenceeng
dc.subjectFRETeng
dc.titleConformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21cze
dc.title.alternativeConformational Study of a Flexibility of the Fluorescence Dye QSY21eng
dc.typebakalářská prácecze
dc.identifier.stag20453
dc.description.abstract-translatedThis bachelor thesis is focused on a theoretical study of the flexibility of the QSY 21 fluorescence dye. The main aim of this work was to find the most stable conformers of the isolated dye and thus provide the suitable starting structure of the dye for the MD simulation of the QSY 21 bound to the DNA. The torsion barrier between the central xanthene ring and the side ring was evaluated, showing the hindered rotation of the side ring.eng
dc.date.accepted2010-06-21
dc.description.departmentPřírodovědecká fakultacze
dc.thesis.degree-disciplineChemiecze
dc.thesis.degree-grantorJihočeská univerzita. Přírodovědecká fakultacze
dc.thesis.degree-nameBc.
dc.thesis.degree-programChemiecze
dc.description.gradeDokončená práce s úspěšnou obhajoboucze
dc.contributor.refereeMinofar, Babak


Soubory tohoto záznamu

Thumbnail
Název:
bakalarkaFINAL.pdf
Velikost:
929.6Kb
Formát:
PDF
Popis:
Plný text práce
Zobrazit/otevřít
Thumbnail
Název:
posudek_vedouciho.pdf
Velikost:
306.4Kb
Formát:
PDF
Popis:
Posudek vedoucího práce
Zobrazit/otevřít
Thumbnail
Název:
posudek_oponenta.pdf
Velikost:
513.4Kb
Formát:
PDF
Popis:
Posudek oponenta práce
Zobrazit/otevřít

Tento záznam se objevuje v

Zobrazit minimální záznam