Instalace a úprava bioinformatického serveru Galaxy

Steinhaisl, Jaroslav

dc.contributor.advisor	Pech, Jiří
dc.contributor.author	Steinhaisl, Jaroslav
dc.date.accessioned	2021-12-06T13:42:07Z
dc.date.available	2021-12-06T13:42:07Z
dc.date.issued	2012
dc.date.submitted	2012-04-24
dc.identifier.uri	https://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/23910
dc.description.abstract	Práce se zabývá instalací a administrací Galaxy serveru s následnou konfigurací a implementací programů vyvinutých na Ústavu molekulární biologie rostlin Biologického centra Akademie věd České republiky, v. v. i. . Konfigurace obsahuje upravení výchozího nastavení serveru pro správnou spolupráci Galaxy serveru s ProFTPD serverem, PostgreSQL databázového serveru a Portable Batch System. Každý bioinformatický program byl zaveden pomocí konfigurace XML souboru, který je použit pro definování vstupů a výstupů programu. Kombinace XML souboru s bioinformatickým programem byla následně testována na datech poskytnutých Laboratoří Molekulární Cytogenetiky.	cze
dc.format	35 s.
dc.format	35 s.
dc.language.iso	cze
dc.publisher	Jihočeská univerzita	cze
dc.rights	Bez omezení
dc.subject	Galaxy server	cze
dc.subject	ProFTPD server	cze
dc.subject	PostgreSQL databázový server	cze
dc.subject	Portable Batch System	cze
dc.subject	Galaxy server	eng
dc.subject	ProFTPD server	eng
dc.subject	PostgreSQL database server	eng
dc.subject	Portable Batch System	eng
dc.title	Instalace a úprava bioinformatického serveru Galaxy	cze
dc.title.alternative	Installation and Administration bioinformatic Galaxy server	eng
dc.type	bakalářská práce	cze
dc.identifier.stag	26857
dc.description.abstract-translated	This work describes the installation and administration of Galaxy server and following configuration and implementation of bioinformatic programs developed by Institute of Plants Molecular Biology of Biology Centre of the Academy of Sciences of the Czech Republic, v. v. i. . Configuration required modification of default server settings to ensure correct co-operation of Galaxy server and ProFTPD server, PostgreSQL database server and the Portable Batch System. Each bioinformatic program was implemented through XML tool configuration file which is used to define user web interface, types of the input and output data and additional options. Each combination of XML configuration file and bioinformatic program was subsequently tested on data files provided by Laboratory of Molecular Cytogenetics.	eng
dc.date.accepted	2012-05-29
dc.description.department	Přírodovědecká fakulta	cze
dc.thesis.degree-discipline	Aplikovaná informatika - specializace Web a multimédia	cze
dc.thesis.degree-grantor	Jihočeská univerzita. Přírodovědecká fakulta	cze
dc.thesis.degree-name	Bc.
dc.thesis.degree-program	Aplikovaná informatika	cze
dc.description.grade	Dokončená práce s úspěšnou obhajobou	cze
dc.contributor.referee	Novák, Petr