| dc.contributor.advisor | Žurovcová, Martina | |
| dc.contributor.author | Jánová, Nicole | |
| dc.date.accessioned | 2025-03-06T08:05:40Z | |
| dc.date.available | 2025-03-06T08:05:40Z | |
| dc.date.issued | 2022 | |
| dc.date.submitted | 2021-12-09 | |
| dc.identifier.uri | https://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/46161 | |
| dc.description.abstract | Cílem této bakalářské práce bylo vybrat a otestovat molekulární markery pro druhovou identifikaci a detekci genetické variability forenzně významných druhů masařek (Sarcophagidae), nejčastěji se vyskytujících v České republice (Sarcophaga variegata, africa, noverca, carnaria, albiceps, incisilobata, lehmanni, argyrostoma, caerulescens). Pro tento účel byly úspěšně amplifikovány a osekvenovány jak mitochondriální (COI), tak i jaderné markery (ITS, EPIC). Bakterie Wolbachia byla detekována pomocí markeru 16S. | cze |
| dc.format | 93 s. | |
| dc.format | 93 s. | |
| dc.language.iso | cze | |
| dc.publisher | Jihočeská univerzita | cze |
| dc.rights | Bez omezení | |
| dc.subject | forenzní entomologie | cze |
| dc.subject | masařky | cze |
| dc.subject | Sarcophagidae | cze |
| dc.subject | genetické markery | cze |
| dc.subject | "DNA barcoding" | cze |
| dc.subject | forensic entomology | eng |
| dc.subject | flesh flies | eng |
| dc.subject | Sarcophagidae | eng |
| dc.subject | genetic markers | eng |
| dc.subject | DNA barcoding | eng |
| dc.title | Genetické markery pro druhovou identifikaci a studium genetické variability forenzně významných druhů masařek (Sarcophagidae). | cze |
| dc.title.alternative | Genetic markers for species identification and study of genetic variability of forensically important Flesh flies (Sarcophagidae). | eng |
| dc.type | bakalářská práce | cze |
| dc.identifier.stag | 62881 | |
| dc.description.abstract-translated | The aim of this thesis was to select and test molecular markers for species identification and detection of genetic variability of forensically important Flesh flies that are most common in the Czech Republic (Sarcophaga variegata, africa, noverca, carnaria, albiceps, incisilobata, lehmanni, argyrostoma, caerulescens). Both mitochondrial (COI) and nuclear (ITS, EPIC) markers were successfully amplified and sequenced for this purpose. Bacteria Wolbachia was detected using the 16S marker. | eng |
| dc.date.accepted | 2022-01-17 | |
| dc.description.department | Přírodovědecká fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-discipline | Biomedicínská laboratorní technika | cze |
| dc.thesis.degree-grantor | Jihočeská univerzita. Přírodovědecká fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-name | Bc. | |
| dc.thesis.degree-program | Biologie | cze |
| dc.description.grade | Dokončená práce s úspěšnou obhajobou | cze |
| dc.contributor.referee | Zrzavá, Magda | |
| dc.description.defence | <p><span arial="" style="font-size:10.0pt;font-family:"><o:p></o:p></span></p>
<p>Obhajoba proběhla prezenčně. Přítomni byli tito členové komise:</p>
<p>Jindřich Chmelař, Magda Zrzavá, Jaroslava Lieskovská, Helena Langhansová, Martina Žurovcová. Dále byla přítomna Hana Sehadová, konzultantka práce. Komise se sešla v plném počtu.</p>
<p>1. Uchazečka představila výsledky své práce</p>
<p>2. Školitelka Martina Žurovcová přečetla hodnocení vedoucí práce.</p>
<p>3. Oponentka Magda Zrzavá přečetla oponentský posudek a vznesla dotazy:</p>
<p>Dotaz 1) Autorka zjistila, že mitochondriální marker COI vykazoval vnitrodruhovou variabilitu jen u tří zkoumaných druhů, zároveň však uvádí, že to mohlo být způsobeno nerovnoměrným množstvím sekvencí získaných z jednotlivých druhů. Neuvažovali jste o získání vlastních vzorků masařek jejich lovem nebo spoluprací s dalšími entomology?</p>
<p>Dotaz 2) V metodách i ve výsledcích autorka zmiňuje, že se nepodařilo osekvenovat PCR produkty markeru ITS. Zároveň jsem v metodách nikde nenašla zmínku, že by měřila množství DNA, které do sekvenační reakce dávala. Možná by kvantifikace DNA mohla pomoci. Také mě napadá, když už byly tyto PCR produkty zaklonované, jestli by nebylo bývalo lepší k jejich amplifikaci použít univerzální primery M13. Odpadla by tak ztráta počátku sekvence, která je vždy špatná, ale v případě amplifikace pomocí M13 by počáteční sekvence patřila vektoru, který je stejně potřeba odstranit.</p>
<p>Uchazečka zodpověděla dotaz. Oponentka vzhesla doplňující dotaz, který uchazečka zodpověděla.</p>
<p>Dotazy z komise: Jak se používají geny pro určení doby smrti v závislosti na ročním období? Jak podobné jsou COI mezi bakteriemi a masařkami? Jaká je třeba odbornost pro forenzní entomologii?</p>
<p>Proběhlo hodnocení - Výborně, 150 bodů</p>
<p><span arial="" style="font-size:10.0pt;font-family:"><o:p></o:p></span></p>
<p><span arial="" style="font-size:10.0pt;font-family:"><o:p></o:p></span></p> | cze |
