| dc.contributor.advisor | Ditrich, Oleg | |
| dc.contributor.author | Čuhajová, Charlotte | |
| dc.date.accessioned | 2021-12-08T13:28:00Z | |
| dc.date.available | 2021-12-08T13:28:00Z | |
| dc.date.issued | 2016 | |
| dc.date.submitted | 2016-05-03 | |
| dc.identifier.uri | https://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/34162 | |
| dc.description.abstract | Tato bakalářská práce se zabývá molekulárně biologickým potvrzením
předpokládaného životního cyklu motolice čeledi Gymnophallidae. Mezihostiteli
jsou mlži Mya truncata, Hiatella arctica a definitivním hostitelem je kajka mořská
Somateria mollissima. Fixované vzorky motolic byly přivezeny ze Svalbardu, kde
byly izolovány z tkání mlžů a kajky. K identifikaci motolic byly použity molekulární
metody.
Na Svalbardu jsou mlži Mya truncata parazitováni s vysokou prevalencí
metacerkáriemi čeledi Gymnophallidae, s menší prevalencí i mlži Hiatella arctica.
Oba druhy jsou významnou složkou potravy kajek Somateria mollissima. Je tedy
pravděpodobné, že kajka je definitivním hostitelem této motolice. Úkolem této práce
je hypotézu potvrdit ztotožněním DNA metacerkárií z mlžů a motolice z kajky.
Posledním cílem bylo vypracovat literární rešerši o motolicích čeledi
Gymnophallidae.
Provedla jsem izolaci DNA jednotlivě z jedinců motolic pomocí tří různých
postupů. První izolace byla provedena fenol-chloroformem z materiálu uloženého
v pufru TNES. Dále s využitím kitu DNeasy Blood and Tissue (Qiagen), a to s
pomocí tekutého dusíku k rozmělnění tkáně a bez tekutého dusíku. Následujícím
krokem byla polymerázová řetězová reakce (PCR) amplifikace vnitřních
přepisovaných mezerníků (ITS rDNA) a oblasti genu cytochrom oxidasy -
podjednotky I (COI) mitochondriální DNA (mtDNA). Získané PCR produkty jsem
vizualizovala pomocí elektroforézy a fragmenty o hledané velikosti jsem izolovala
pomocí kitů QIAquick Spin (Qiagen) a Gene All Expin Combo (GeneAll). Přečištěné
PCR produkty jsem odeslala firmě Seqme, která z nich připravila sekvence.
Totožnost s metacerkáriemi Hiatella arctica nebyla prokázána, pravděpodobně
z důvodu špatné amplifikace DNA metacerkárie z Hiatella arctica nebo nedostatku
získané templátové DNA v PCR. Následné klonování DNA metacerkárie z Hiatella
arctica se nezdařilo.
Juvenilní motolice čeledi Gymnophallidae izolovaná ze střeva kajky je totožným
druhem s metacerkáriemi z Mya truncata. | cze |
| dc.format | 68 | |
| dc.format | 68 | |
| dc.language.iso | cze | |
| dc.publisher | Jihočeská univerzita | cze |
| dc.rights | Bez omezení | |
| dc.subject | Motolice
Gymnophallidae
Molekulární diagnostika
ITS2.2. sekvence
COI sekvence
PCR | cze |
| dc.subject | Trematode
Gymnophallidae
Molecular diagnostics
ITS2.2. sequences
COI sequences
PCR | eng |
| dc.title | Motolice čeledi Gymnophallidae na Svalbardu | cze |
| dc.title.alternative | Flukes family Gymnophallidae on Svalbard | eng |
| dc.type | bakalářská práce | cze |
| dc.identifier.stag | 46909 | |
| dc.description.abstract-translated | This thesis deals with the molecular biological confirmation of anticipated life
cycle of gymnophallid trematode. Specific intermediate hosts are bivalves Mya
truncata, Hiatella arctica and final host is eider Somateria mollissima. Fixed samples
of trematodes were brought from Svalbard, where they were isolated
from tissues of molluscs and eider. Molecular methods were used to identify
trematode species.
On Svalbard thw bivalves Mya truncata are parasitized with a high prevalence
with metacercariae of family Gymnophallidae, and Hiatella arctica with less
prevalence. Both species are an important food component of eider Somateria
mollissima. Therefore the eider is probably the definitive host of this trematode. The
task of this work is to confirm this hypothesis by identifying DNA
from etacercariae and the trematode from eider.
The additional task was to prepare literature search about Gymnophallidae
family.
The trematode DNA isolation was performed by using three methods. First
isolation was performed using phenol-chloroform TNES buffer, followed by liquid
nitrogen and without liquid nitrogen with the kit DNeasy Blood and Tissue Kit
(Qiagen). The next step was a PCR amplification and sequence using ITS and COI.
Then, electrophoresis was carried out and the resulting DNA fragments were further
isolated and forwarded to Seqme company which carried out the parasite DNA
sequencing.
Identity with metacercaria from Hiatella arctica has not been clearly
demonstrated, because of bad amplification of DNA from trematode from Hiatella
arctica. Subsequent cloning DNA trematode from Hiatella arctica failed.
Gymnophallid trematode isolated from the eider gut is the identical species
as metacercaria from Mya truncata. | eng |
| dc.date.accepted | 2016-06-10 | |
| dc.description.department | Zdravotně sociální fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-discipline | Zdravotní laborant | cze |
| dc.thesis.degree-grantor | Jihočeská univerzita. Zdravotně sociální fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-name | Bc. | |
| dc.thesis.degree-program | Specializace ve zdravotnictví | cze |
| dc.description.grade | Dokončená práce s úspěšnou obhajobou | cze |
| dc.contributor.referee | Kvičerová, Jana | |
