Proč je <i>Gloeocapsa</i> fialová- identifikace gleocapsinu, UV-protektivního pigmentu sinic.
Abstrakt
Gloeocapsin je pigment o neznámé chemické struktuře, který se vyskytuje ve slizových obalech některých terestrických sinic a vyznačuje se acidobazickou barevnou reakcí. V rámci této bakalářské práce byly izolovány kolonie potenciálních producentů UV-protektivního barviva gloeocapsinu z rodu Gloeocapsa, pocházející z přírodních vzorků epilitických nárostů sinic z lokalit PR Opolenec, PR Holubovské hadce a PR Bořinka v České republice. Taxonomická identita jednotlivých kolonií byla potvrzena pomocí mikroskopické analýzy a sekvenace genu pro 16S rRNA. Na závěr byly získány sekvence celého genomu tří vybraných druhů (Gloeocapsa novacekii, G. violascea a G. atrata) pomocí amplifikace genomu metodou multiple-displacement amplification z jednotlivých kolonií a jejich sekvenace na platformě Illumina. Získaná data budou v navazující práci využita k identifikaci genů pro biosyntézu gloeocapsinu.