| dc.contributor.advisor | Mareš, Jan | |
| dc.contributor.author | Shchunina, Anastasiia | |
| dc.date.accessioned | 2026-01-06T11:54:17Z | |
| dc.date.available | 2026-01-06T11:54:17Z | |
| dc.date.issued | 2023 | |
| dc.date.submitted | 2023-04-13 | |
| dc.identifier.uri | https://dspace.jcu.cz/handle/20.500.14390/48511 | |
| dc.description.abstract | Gloeocapsin je pigment o neznámé chemické struktuře, který se vyskytuje ve slizových obalech některých terestrických sinic a vyznačuje se acidobazickou barevnou reakcí. V rámci této bakalářské práce byly izolovány kolonie potenciálních producentů UV-protektivního barviva gloeocapsinu z rodu Gloeocapsa, pocházející z přírodních vzorků epilitických nárostů sinic z lokalit PR Opolenec, PR Holubovské hadce a PR Bořinka v České republice. Taxonomická identita jednotlivých kolonií byla potvrzena pomocí mikroskopické analýzy a sekvenace genu pro 16S rRNA. Na závěr byly získány sekvence celého genomu tří vybraných druhů (Gloeocapsa novacekii, G. violascea a G. atrata) pomocí amplifikace genomu metodou multiple-displacement amplification z jednotlivých kolonií a jejich sekvenace na platformě Illumina. Získaná data budou v navazující práci využita k identifikaci genů pro biosyntézu gloeocapsinu. | cze |
| dc.format | 44 | |
| dc.format | 44 | |
| dc.language.iso | cze | |
| dc.publisher | Jihočeská univerzita | cze |
| dc.rights | Bez omezení | |
| dc.subject | sinice | cze |
| dc.subject | Gloeocapsa | cze |
| dc.subject | Gloeocapsa alpina | cze |
| dc.subject | Gloeocapsa violascea | cze |
| dc.subject | Gloeocapsa atrata | cze |
| dc.subject | Gloeocapsa novacekii | cze |
| dc.subject | gloeocapsin | cze |
| dc.subject | UV-protektivní pigment | cze |
| dc.subject | 16S rRNA | cze |
| dc.subject | MDA | cze |
| dc.subject | Illumina | cze |
| dc.subject | Fylogenetická analýza | cze |
| dc.subject | genom | cze |
| dc.subject | cyanobacteria | eng |
| dc.subject | Gloeocapsa | eng |
| dc.subject | Gloeocapsa alpina | eng |
| dc.subject | Gloeocapsa violascea | eng |
| dc.subject | Gloeocapsa atrata | eng |
| dc.subject | Gloeocapsa novacekii | eng |
| dc.subject | gloeocapsin | eng |
| dc.subject | UV-protective pigment | eng |
| dc.subject | 16S rRNA | eng |
| dc.subject | MDA | eng |
| dc.subject | Illumina | eng |
| dc.subject | Phylogenetic analysis | eng |
| dc.subject | genome | eng |
| dc.title | Proč je <i>Gloeocapsa</i> fialová- identifikace gleocapsinu, UV-protektivního pigmentu sinic. | cze |
| dc.title.alternative | Why is <i>Gloeocapsa</i> purple - identification of gloeocapsin, the UV-protective pigment of cyanobacteria. | eng |
| dc.type | bakalářská práce | cze |
| dc.identifier.stag | 65972 | |
| dc.description.abstract-translated | Gloeocapsin is a pigment of unknown chemical structure that occurs in the mucilaginous sheaths of some terrestrial cyanobacteria and is characterized by an acid-base color reaction. As part of this bachelor's thesis, colonies of potential producers of the UV-protective pigment gloeocapsin from the genus Gloeocapsa were isolated, originating from natural samples of epilithic cyanobacterial growths from PR Opolenec, PR Holubovské hadce and PR Bořinka in the Czech Republic. The taxonomic identity of individual colonies was confirmed by microscopic analysis and sequencing of the 16S rRNA gene. Finally, the whole genome sequences of three selected species (Gloeocapsa novacekii, G. violascea and G. atrata) were obtained using genome amplification by the multiple-displacement amplification method from individual colonies and their sequencing on the Illumina platform. The obtained data will be used in subsequent work to identify genes for the biosynthesis of gloeocapsin. | eng |
| dc.date.accepted | 2023-05-22 | |
| dc.description.department | Přírodovědecká fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-discipline | Biologie | cze |
| dc.thesis.degree-grantor | Jihočeská univerzita. Přírodovědecká fakulta | cze |
| dc.thesis.degree-name | Bc. | |
| dc.thesis.degree-program | Biologie | cze |
| dc.description.grade | Dokončená práce s úspěšnou obhajobou | cze |
| dc.contributor.referee | Hauer, Tomáš | |
| dc.description.defence | <p>Představení bakalářské práce. Školitelský posudek J. Mareše - detailní popis úskalí práce, pochvala kvalitní práce studentky i drobných nedostatků. Oponentský posudek T. Hauera. Diskuse o vhodnosti názvu práce, determinaci substrátu, na kterém byly uskutečněny sběry, použitých metodách analýzy dat, přesnosti citací, barvě zkoumaných organismů atd. Celkově práce hodnocena pozitivně. </p>
<p>Diskuse členů komise: J. Kaštovský - příčiny změny barvy., K. Prach ekologické nároky zkoumaných druhů, J. Kučera - interpretace fylogenetického stromu, P. Koutecký - skládání genomu.</p>
<p>Různá úroveň odpovědí studentky, . </p>
<p>Průměr 1.17, přidělený počet bodů 138 </p> | cze |
